Краткосрочните благоприятни ефекти от спиране на пушенето се запазват 6 месеца след преминаване от цигари на системата за нагряване на тютюн. За пет от осем биомаркера за клиничен риск от развитие на заболявания, свързани с тютюнопушенето, когато 70% от употребата на тютюн e чрез СНТ, процентът е 40% от ефекта на спиране на пушене. За тези потребители на СНТ, чиито уринен тест показва, че вероятно са спрели да пушат, над 2/3 от ефекта при спиране на пушенето се запазва при седем от осемте биомаркера за потенциална вреда. Това показва, че преминаването на СНТ има потенциал да намали риска от развитие на заболявания, свързани с пушенето при пушачите, които в противен случай биха продължили да пушат цигари.